Caracterización molecular de Heliconia sp. Utilizando la técnica RAPD.
Molecular characterization of Heliconia sp. using RAPD technique.
Freddy Gutierrez, Roberson Ramirez, Pedro Adrianzén, Marianela Cobos, Sergio Pinedo, Sixto Imán, Juan Castro
Centro de Investigaciones de Recursos Naturales de la Amazonia (CIRNA), 496S.
Universidad Nacional de la Amazonia Peruana-UNAP. Apartado postal 496S Facultad de Ciencias Biológicas.
Instituto Nacional de Innovación Agraria (INIA), C.P. 609.
DOI: https://doi.org/10.33017/RevECIPeru2011.0051/
RESUMEN
Este trabajo se realizó entre los meses de Julio a Setiembre del 2010, con el objetivo de caracterizar molecularmente a la especie Heliconia sp. Utilizando el marcador molecular RAPD. Para esto, se realizó la purificación del ADN genómico de la especie en estudio obteniéndose buenos resultados en cuanto a la calidad y la cantidad del ADN purificado, el cual fue verificado con los métodos electroforético y espectrofotométrico, la cantidad de ADN obtenido en promedio fue de 92.8 ng/ μl, asimismo el ratio de calidad promedio fue de 2.2. Para la amplificación de los productos de la PCR se empleó el iniciador MT3R, obteniéndose mucho polimorfismo. Los productos de la PCR tuvieron tamaños de 750 pb hasta 2050 pb. En cuanto a la caracterización molecular, se realizó un dendograma (UPGMA) utilizando el programa estadístico NTSIS versión 2.0. Asimismo se obtuvo la formación de 2 grupos (clusters) y 2 fugas donde se observó la aparición de “aparentes duplicados” en algunos de ellos, es decir, que comparten el mismo patrón genético con un 100% de similitud. Además el valor de la heterocigosidad esperada fue de 0.14, valor relativamente bajo, posiblemente al tipo de reproducción que posee este género, el cual es la autogamica.
Descriptores: ADN genómico, Heliconia sp, electroforético, espectrofotométrico.
ABSTRACT
This work was carried out between the months of July to September 2010 with the objective of molecular characterization of the species heliconia sp using the RAPD molecular marker. For this, we performed the purification of genomic DNA, of the species under study with good results in terms of quality and quantity of purified DNA, which was verified by electrophoretic and spectrophometric methods, the amount of DNA obtained was on average 92.8 ng/ l, also the ratio of average quality was 2.2. For amplification of PCR products was used MT3R initiator, obtaining much polymorphism. PCR products had sizes of 750 bp to 2050 bp. as for the molecular characterization, we performed a dendrogram (UPGMA) using the statiscal sofwar version 2.0 NTSIS. It also obtained the formation of 2 groups (clusters) and 2 leaks where we the appearance of “apparent duplicates” in some of them, ie they share the same genetic patern with 100% similarity. Also, the value of expected heterozygosity was 0.14, relatively low value, possibly the type of reproduction that has this kind, which is the autogamous.
Keywords: genomic DNA, Heliconia sp, electrophoretic, spectrophometric.